PROMO和Jaspar数据库哪个准,新手使用数据库哪个数据库软件比较好用啊
来源:整理 编辑:黑码技术 2024-01-15 22:00:21
本文目录一览
1,新手使用数据库哪个数据库软件比较好用啊
当然mysql啦,界面整洁操作简单,适合新手使用http://www.downxia.com/downinfo/78104.html初学建议用mysql,或sql server。当你较熟练会运用时,可去用oracle,毕竟数据库oracle的影响力在目前是强大的。
2,预测转录元件的数据库the jaspar database怎么使用
如何用JASPAR查询基因转录结合位点你看自己做的那个物种有没有基因组序列,如果有在NCBI中先找到自己要做的基因,然后找到基因组序列,做blast后在基因组上选取上游的大概1000多个碱基,然后用分析,一般就找到转录起始位点了,转录起始位点也就在启动子位置。如果没有基因组序列,就比较麻烦,需要用染色体位移技术,先克隆到哪个序列,在用做分析。用分析后,还需要用实验验证,才能完全确定你需要的转录起始位点。

3,学习数据库学哪个数据库比较好
商业应用中主要是关系数据库,比如Oracle、DB2、Sybase、MS SQL Server、Informax、MySQL等。全部罗列出来是没有意义的,数据库太多了,你不说你的工作是涉及哪方面,恐怕很难提供更适合你的数据库。初级应用一般是ACCESS 配合的脚本程序一般是 ASP ASP.NET JSPMICROSOFT SQL 比较复杂点 不过功能强大很多 配合的脚本和ACCESS的一样MYSQL和PHP的组合是比较完美的如果你需要处理1000W条数据以上级别的数据,那以上的都不合适,一般用的比较多的是ORACLE 这个入门难度非常大如果想学的话就先学MICROSOFT SQL吧,这个网上教学比较多,ASP.NET 2.0,应用的是非常广泛的。sql server相对来说比较简单一些;oracle就比较复杂一些,而且两者在一些概念上有比较大的不同.从工作收入上来讲,oracle要远远高于sql server.不知道这样说,你自己心里面是否有了一个比较了?看你着重于急于掌握一门数据库还是为了寻求好的待遇.
4,如何检测转录因子与启动子的结合能力
查询某一基因的启动子区有无某转录因子的结合位点可尝试用缺失分析,应先用Matinspector 预测有无转录因子结合位点的存在,然后将启动子区域克隆,构建一系列区域突变克隆,与基因编码转录因子的基因共表达,检测报告基因的表达,来判断转录因子同一个基因的启动子都是可长可短的,只是不同长度可能启动子的活性不一样。真核生物一般都是认为在第一外显子上游的2kb以内(也有2kb以外的)。转录因子不同的预测方法(除了PROMO,还可用Jaspar 、TFSEARCH、TRANSFAC等数据库)结果都不一样,最终只有实验验证的才准确。
5,thermocalc 与jmatpro 哪个准
Thermo-Calc是所有各种热力学和相图计算的通用和柔性的软件包,是建立于强大的Gibbs能最小化基础之上的。 它是多于30年和100人年的劳动以及很多各种项目的国际合作的结果。 Thermo-Calc软件可使用多种热力学数据库,特别是热力学数据库的国际合作组织Scientific Group Thermodata Europe(SGTE)开发的数据库。 Thermo-Calc已获得世界性的计算多元相图最好软件的荣誉,今天遍及世界得多与600家安装了该软件,包括科技的和非科技的研究院所,在技术文献上是一个很好的参考。 它是仅有的计算在一个非常复杂的多元不均匀系中有多于5个独立变量的任意相图断面的软件,也有计算很多其它类型图的工具,如CVD沉积、Scheil-Gulliver凝固模拟、Pourbaix图、气体分压等。 在Thermo-Calc例子中给出了很多应用实例,这些实例也可从TCSAB的web地址中找到。 用Thermo-Calc进行的热力学计算和用DICTRA进行的动力学模拟可戏剧性地加强制造过程的设计能力、热处理温度的选择能力、过程收益的优化能力等,这些易于理解的软件/数据库/界面包已经在世界范围内证明是最有力和最有柔性的排除昂贵和费时的实验、改进质量性能和控制环境影响的工程工具。
6,转录因子结合位点预测strand1什么意思
可以预测Transcription factor binding site的数据库有:1.用Jaspar http://jaspar.genereg.net/2.用PROMO http://alggen.lsi.upc.es/cgi-bin/promo_v3/promo/promoinit.cgi?dirDB=TF_8.33.用TFSEARCH(据说用的是TRANSFAC很旧的数据库) http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.html4.用商业数据库TRANSFAC(要付费) http://www.gene-regulation.com/pub/databases.html/
7,在英文文献数据库中地位类似于知网的是哪个数据库啊
<p>Elsevier ScienceDirect</p><p>Elsevier是荷兰一家全球著名的学术期刊出版商,每年出版大量的学术图书和期刊,大部分期刊被SCI、SSCI、EI收录,是世界上公认的高品位学术期刊。近几年该公司将其出版的1100多种期刊全部数字化,即ScienceDirect全文数据库,并通过网络提供服务。该数据库涉及众多学科:计算机科学、工程技术、能源科学、环境科学、材料科学、数学、物理、化学、天文学、医学、生命科学、商业、及经济管理、社会科学等。</p> <p></p> <p>Web of Knowledge(Web of Science)</p><p>大型综合性、多学科、核心期刊引文索引数据库,包括SCI、SSCI、A&HCI和两个化学信息事实型数据库CCR、IC,以及SCI-E、CPCI-S、CPCI-SSH三个引文数据库,以ISI Web of Knowledge作为检索平台。</p> <p></p> <p>化学相关,还常常用SciFinder Scholar。美国化学学会ACS旗下的化学文摘服务社CAS所出版的Chemical Abstract化学文摘的在线版数据库学术版</p>
8,该选择哪个开源数据库哪一个更好
Access是一种桌面数据库,只适合数据量少的应用,在处理少量数据和单机访问的数据库时是很好的,效率也很高。但是它的同时访问客户端不能多于4个。Microsoft Access数据库有一定的极限,如果数据达到100M左右,很容易造成服务器iis假死,或者消耗掉服务器的内存导致服务器崩溃,表现为英文“Service Unavailable”。 MS SQL Server是基于服务器端的中型的数据库,可以适合大容量数据的应用,在功能上管理上也要比Microsoft Access要强得多。在处理海量数据的效率,后台开发的灵活性,可扩展性等方面强大。因为现在数据库都使用标准的SQL语言对数据库进行管理,所以如果是标准SQL语言,两者基本上都可以通用的。Microsoft SQL Server还有更多的扩展,可以用存储过程,数据库大小无极限限制。 MySql短小精悍,像access一样的文件型数据库,但比access强百倍,是真正多用户多任务的数据库系统,从Linux上移植过来的,安全性非常好,不过大部分操作是在dos下进行,虽然也有第三方开发的图形界面但并不好用。MySQL是跨多平台的数据库管理软件,可运行于LINUX、NT、UNIX等系统,可支持命令和图形化管理,对于一般的数据库足以应付了,占用系统资源较少,速度较快,而且是开源的。 Oracle各方面都比较成熟,但对硬件要求高,用于数据完整性、安全性要求较高的场合,能在所有主流平台上运行,完全支持所有的工业标准,采用完全开放策略。可以使客户选择最适合的解决方案,对开发商全力支持。平行服务器通过使一组结点共享同一簇中的工作来扩展服务器的能力,提供高可用性和高伸缩性的簇的解决方案,获得最高认证级别的iso标准认证,多层次网络计算,支持多种工业标准,可以用odbc,jdbc,oci等网络客户连接,较复杂,同时提供gui和命令行,在windows和unix下操作相同,如果windows不能满足需要,用户可以把数据库移到unix中。其操作和设置比较复杂,适用于有一定操作经验的用户。 db2 能在所有主流平台上运行(包括windows)。最适于海量数据。DB2在企业级的应用最为广泛, 在全球的500家最大的企业中,几乎85%以上用DB2数据库服务器,而国内到97年约占5%。 总之,各个主流数据库各有优势与侧重,对于初学者而言,建议从MS SQL Server 着手学习,众所周知,微软的东西么,简单易懂。如果打算为项目选择一款免费、开源的数据库,那么你可能会在mysql与postgresql之间犹豫不定。mysql与postgresql都是免费、开源、强大、且功能丰富的数据库。你主要的问题可能是:哪一个才是最好的开源数据库,mysql还是postgresql呢?该选择哪一个开源数据库呢? 在选择数据库时,你所做的是个长期的决策,因为后面如果再改变决定将是非常困难且代价高昂的。你希望一开始就选择正确。两个流行的开源数据库mysql与postgresql常常成为最后要选择的产品。对这两个开源数据库的高层次概览将会有助于你选择最适合自己需要的。 mysql mysql相对来说比较年轻,首度出现在1994年。它声称自己是最流行的开源数据库。mysql就是lamp(用于web开发的软件包,包括linux、apache及perl/php/python)中的m。构建在lamp栈之上的大多数应用都会使用mysql,包括那些知名的应用,如wordpress、drupal、zend及phpbb等。 一开始,mysql的设计目标是成为一个快速的web服务器后端,使用快速的索引序列访问方法(isam),不支持acid。经过早期快速的发展之后,mysql开始支持更多的存储引擎,并通过innodb引擎实现了acid。mysql还支持其他存储引擎,提供了临时表的功能(使用memory存储引擎),通过myisam引擎实现了高速读的数据库,此外还有其他的核心存储引擎与第三方引擎。 mysql的文档非常丰富,有很多质量不错的免费参考手册、图书与在线文档,还有来自于oracle和第三方厂商的培训与支持。 mysql近几年经历了所有权的变更和一些颇具戏剧性的事件。它最初是由mysql ab开发的,然后在2008年以10亿美金的价格卖给了sun公司,sun公司又在2010年被oracle收购。oracle支持mysql的多个版本:standard、enterprise、classic、cluster、embedded与community。其中有一些是免费下载的,另外一些则是收费的。其核心代码基于gpl许可,对于那些不想使用gpl许可的开发者与厂商来说还有商业许可可供使用。 现在,基于最初的mysql代码还有更多的数据库可供选择,因为几个核心的mysql开发者已经发布了mysql分支。最初的mysql创建者之一michael "monty" widenius貌似后悔将mysql卖给了sun公司,于是又开发了他自己的mysql分支mariadb,它是免费的,基于gpl许可。知名的mysql开发者brian aker所创建的分支drizzle对其进行了大量的改写,特别针对多cpu、云、网络应用与高并发进行了优化。 postgresql postgresql标榜自己是世界上最先进的开源数据库。postgresql的一些粉丝说它能与oracle相媲美,而且没有那么昂贵的价格和傲慢的客服。它拥有很长的历史,最初是1985年在加利福尼亚大学伯克利分校开发的,作为ingres数据库的后继。 postgresql是完全由社区驱动的开源项目,由全世界超过1000名贡献者所维护。它提供了单个完整功能的版本,而不像mysql那样提供了多个不同的社区版、商业版与企业版。postgresql基于自由的bsd/mit许可,组织可以使用、复制、修改和重新分发代码,只需要提供一个版权声明即可。 可靠性是postgresql的最高优先级。它以坚如磐石的品质和良好的工程化而闻名,支持高事务、任务关键型应用。postgresql的文档非常精良,提供了大量免费的在线手册,还针对旧版本提供了归档的参考手册。postgresql的社区支持是非常棒的,还有来自于独立厂商的商业支持。 数据一致性与完整性也是postgresql的高优先级特性。postgresql是完全支持acid特性的,它对于数据库访问提供了强大的安全性保证,充分利用了企业安全工具,如kerberos与openssl等。你可以定义自己的检查,根据自己的业务规则确保数据质量。在众多的管理特性中,point-in-time recovery(pitr)是非常棒的特性,这是个灵活的高可用特性,提供了诸如针对失败恢复创建热备份以及快照与恢复的能力。但这并不是postgresql的全部,项目还提供了几个方法来管理postgresql以实现高可用、负载均衡与复制等,这样你就可以使用适合自己特定需求的功能了。
文章TAG:
promo 数据 数据库 哪个 PROMO和Jaspar数据库哪个准
相关文章推荐
- vipkk插件
- vb语音插件,vb开发excel插件
- ai转psd格式大文件插件,psd格式转ai可以编辑
- 日历插件不兼容ie,zoteroquicklook插件不兼容
- 一键恢复越狱插件
- 语音朗读插件添加语音,心经语音朗读语音版在线听
- 怎么写apktool的插件,apktool助手1.8.0版本插件
- 快速查看 插件 mac,如何查看QQ插件
- ios9通知中心透明插件
- wordpress自定义字段插件,WordPress自定义字段
- uc云同步 chrome插件,Chrome书签同步插件
- chrome云收藏插件,手机chrome扩展插件在哪里
- dn插件下载,dn turbo下载
- 网页游戏小程序开发,网页和小程序哪一个开发更容易
- 童程童美工作赚钱吗,惠州童程童美的招聘是不是真的啊有人去过的吗