GEO数据库包含哪些,ebi数据库跟geo数据库的数据是一样的么
来源:整理 编辑:黑码技术 2024-01-13 02:59:23
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1,ebi数据库跟geo数据库的数据是一样的么
:ArcGIS是围绕着Geodatabase数据库构建的,它使用对象关系型数据库来存储空间数据。Geodatabase是一个存储数据集的容器,同时将空间数据和属性绑定起来。拓扑数据也能够存储在Geodatabase中并对特性进行建模如果是要初步的筛选,最好用至少3个数据库进行预测,然后取共有的target gene进行下一步的验证,常用的数据库有targetscan,rna22,mirbase,pita,microcosom等等
2,Geodatabse空间数据库模型的特点是什么
1、空间参考。Geodatabse在要素类和数据集中对空间参考信息进行了完整的定义。 2、表定义。Geodatabse空间几何数据与属性数据保存在同一个表(要素类)中。 3、拓扑规则。Geodatabse的拓扑关系管理机制在以下几个方面有明显的优势: 1) 用户可以自行定义哪些要素类将手拓扑关系规则约束。 2) 多个点、线、面要素类(层)可以同时受同一组拓扑关系规则约束。 3) 提供了大量的拓扑关系规则。 4) 用户为自己的数据可以自行指定必要的拓扑关系约束规则。 5) 拓扑关系及规则是在符合工业标准的DMBS(数据管理系统)中进行的,可以多用户并发处理。 6) 用户可以局部建立或检查拓扑关系,以提高生产率。 4、可以表达复杂的地理要素(如,河流网络、电线杆等)。
Geotools是Java语言编写的开源GIS工具包。该项目已有十多年历史,生命力旺盛,代码非常丰富,包含多个开源GIS项目,并且基于标准的GIS接口。Geotools主要提供各种GIS算法,各种数据格式的读写和显示。在显示方面要差一些,只是用Swing实现了地图的简单查看和操作。但是用户可以根据Geotools提供的算法自己实现地图的可视化。OpenJump和udig就是基于Geotools的。Geotools用到的两个较重要的开源GIS工具包是JTS和GeoAPI。前者主要是实现各种GIS拓扑算法,也是基于GeoAPI的。但是由于两个工具包的GeoAPI分别采用不同的Java代码实现,所以在使用时需要相互转化。Geotools又根据两者定义了部分自己的GeoAPI,所以代码显得臃肿,有时容易混淆。由于GeoAPI进展缓慢,Geotools自己对其进行了扩充。另外,Geotools现在还只是基于2D图形的,缺乏对3D空间数据算法和显示的支持。
4,求基因表达常用数据库
http://www.geneticsofgeneexpression.org/network/IARS2-003指isoleucyl-tRNA synthetase 2基因003转录本。ENST00000490891是IARS2-003的transcript ID,OTTHUMT00000090763是另一个数据库对同一转录本的编号(Havana transcript)。http://asia.ensembl.org/Homo_sapiens/Transcript/Summary?db=core;g=ENSG00000067704;r=1:220267444-220321380;t=ENST00000490891UCSC Microarray Expression Data 给出了基因mRNA在人类不同组织中的表达量http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgGene?hgg_gene=uc001hmc.2&hgg_prot=B2RPG8&hgg_chrom=chr1&hgg_start=220267454&hgg_end=220321376&hgg_type=knownGene&db=hg19&hgsid=193781719GEO数据库给出了详细的基因mRNA在不同组织中的表达数据,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/基因的表达量不等于转录本的表达量,特定转录本IARS2-003的表达量需要自行实验证明。应该有这类数据库。自己找找。最好看文献。再看看别人怎么说的。
5,java 使用geoip需要导入什么包
GeoIP数据库下载地址:http://geolite.maxmind.com/download/geoip/database/GeoLiteCountry/GeoIP.dat.gzAPI 源码下载 http://geolite.maxmind.com/download/geoip/api/java/下载解压:有一些测试类 “*test.java”,如 CountryLookupTest.java 将所有源码拷贝在一个java工程下面... 改下源码的Geoip.dat文件的目录 :我是放在C盘; 代码: Java代码 class CountryLookupTest public static void main(String[] args) try // String sep = System.getProperty("file.separator"); // // // Uncomment for windows // String dir = System.getProperty("user.dir"); // // // Uncomment for Linux // //String dir = "/usr/local/share/GeoIP"; // // String dbfile = dir + sep + "GeoIP.dat"; // You should only call LookupService once, especially if you use // GEOIP_MEMORY_CACHE mode, since the LookupService constructor // takes up // resources to load the GeoIP.dat file into memory // LookupService cl = new // LookupService(dbfile,LookupService.GEOIP_STANDARD); LookupService cl = new LookupService("c:\\GeoIP.dat", LookupService.GEOIP_MEMORY_CACHE); System.out.println(cl.getCountry("159.226.115.22").getCode()); System.out.println(cl.getCountry("159.226.115.22").getName()); System.out.println(cl.getCountry("183.16.200.127").getName()); System.out.println(cl.getCountry("213.52.50.8").getName()); System.out.println(cl.getCountry("200.21.225.82").getName()); cl.close(); } catch (IOException e) System.out.println("IO Exception"); } } }手机ip在上网功能设置里面! ip是:10.0.0.172 愿你开心!
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