kegg数据库包括哪些途径，运用KEGG数据库查询某个基因注释到哪些通路

1，运用KEGG数据库查询某个基因注释到哪些通路

运用KEGG数据库查询某个基因注释到哪些通路最简单，但是未必最有效的办法，但是最快抽个样本，把你的目标基因打上标记，然后建立一个模型，比如决策树等等模型质量不错的情况下跑全库，然后找出分类结果为你目标分类的记录

运用KEGG数据库查询某个基因注释到哪些通路

2，kegg数据库包括哪些代谢通路

基因功能定位这个很复杂，可以专门开一篇文章了，暂且到此。假设我们现在有了基因序列及其功能，我们接下来也会知道该基因合成了哪些蛋白，参与了哪些化学反应。代谢是细胞内各种化学反应的总称，一个代谢途径包括代谢的前提、产物和酶。

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3，GO 和 KEGG 的区别

一直都搞不清楚这两者的具体区别，只知道是将基因富集到代谢上。前者是功能注释，即每个基因可能参与哪些pathway terms 或者 GO terms，没有阀值的。后者是功能富集，即基因集（多个基因）可能显著的集中在哪些功能上面例如选择P<0.05.得到的结果都是显著性富集的pathway terms或者GO terms。GO GO是Gene ontology的缩写，GO数据库分别从功能、参与的生物途径及细胞中的定位对基因产物进行了标准化描述即对基因产物进行简单注释，通过GO富集分析可以粗略了解差异基因富集在哪些生物学功能、途径或者细胞定位。 Pathway Pathway指代谢通路，对差异基因进行pathway分析，可以了解实验条件下显著改变的代谢通路，在机制研究中显得尤为重要。GO分析好比是将基因分门别类放入一个个功能类群的篮子，pathway则是将基因一个个具体放到代谢网络中的指定位置。

1、属性不同Go（又称 Golang）是 Google 的 Robert Griesemer，Rob Pike 及 Ken Thompson 开发的一种静态强类型、编译型语言。功能：内存安全，GC（垃圾回收），结构形态及 CSP-style 并发计算。KEGG 是了解高级功能和生物系统（如细胞、生物和生态系统），从分子水平信息，尤其是大型分子数据集生成的基因组测序和其他高通量实验技术的实用程序数据库资源，是国际最常用的生物信息数据库之一，以“理解生物系统的高级功能和实用程序资源库”著称。2、性质不同go是计算机编程语言。KEGG基因组破译方面的数据库。扩展资料：Go的语法接近C语言，但对于变量的声明有所不同。Go支持垃圾回收功能。Go的并行模型是以东尼·霍尔的通信顺序进程（CSP）为基础，采取类似模型的其他语言包括Occam和Limbo。但它也具有Pi运算的特征，比如通道传输。在1.8版本中开放插件（Plugin）的支持，这意味着现在能从Go中动态加载部分函数。与C++相比，Go并不包括如枚举、异常处理、继承、泛型、断言、虚函数等功能，但增加了切片(Slice) 型、并发、管道、垃圾回收、接口（Interface）等特性的语言级支持。Go 2.0版本将支持泛型，对于断言的存在，则持负面态度，同时也为自己不提供类型继承来辩护。不同于Java，Go内嵌了关联数组（也称为哈希表（Hashes）或字典（Dictionaries）），就像字符串类型一样。KEGG是一个整合了基因组、化学和系统功能信息的数据库。把从已经完整测序的基因组中得到的基因目录与更高级别的细胞、物种和生态系统水平的系统功能关联起来是KEGG数据库的特色之一。人工创建了一个知识库，这个知识库是基于使用一种可计算的形式捕捉和组织实验得到的知识而形成的系统功能知识库。它是一个生物系统的计算机模拟。与其他数据库相比，KEGG 的一个显著特点就是具有强大的图形功能，它利用图形而不是繁缛的文字来介绍众多的代谢途径以及各途径之间的关系，这样可以使研究者能够对其所要研究的代谢途径有一个直观全面的了解。参考资料来源：搜狗百科-go参考资料来源：搜狗百科-KEGG

GO 和 KEGG 的区别