ensg是哪个数据库的,请问一些生物信息学的问题 NCBI Entrez 数据库系统中都有哪些数据库
来源:整理 编辑:黑码技术 2024-03-07 01:25:07
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1,请问一些生物信息学的问题 NCBI Entrez 数据库系统中都有哪些数据库
NCBI数据库主要有:核苷酸序列数据库 、
基因组数据库、
分子模型数据库、
生物学门类数据库还有一些蛋白组学数据库等等。
EST数据主要指
指不同组织的cDNA序列,就是 包含各种表达序列标签(expressed sequence tags,ESTs)的数据库,一般用来识别基因,绘制基因图谱等。
2,有谁知道好象是奥瑞科数据库的英文全称
OracleOracle在数据库领域一直处于领先地位。Oracle关系数据库系统是目前世界上流行的关系数据库管理系统,系统可移植性好、使用方便、功能强,适用于各类大、中、小、微机环境。Oracle9i是Oracle于今年6月份正式推出的数据库最新产品。Oracle9i在可伸缩性、可靠性和完整性方面有着上佳的表现.
3,ensembl数据库中的ensg是啥意思
在ncbi上的omim数据库输入基因名,在title上就会显示它的学名。用学名检索基因是比较靠谱的。建议用ensembl找基因,显示其外显子和内含子。进入ensembl的方法有两种,1.ncbi上进入基因的检索条以后,summary里会有相应的ensembl的链接(see related);2.直接进入ensembl主页检索该基因。进入基因的检索条以后,点左侧的cdna和exons就能相应地看到转录本的注释信息,包括外显子和内含子的注释,5和3utr的注释,和密码子的注释。名字错了当然没关系,只要序列正确就能用,一般来说,上游引物是正义链5端开始序列,下游引物是反义链5端序列从5端开始到3端比对一下,碱基顺序没错的话可以用,换个名字而已。
4,微擎是mysql 还是mssql
MS SQL是指微软的SQLServer数据库服务器,它是一个数据库平台,提供数据库的从服务器到终端的完整的解决方案,其中数据库服务器部分,是一个数据库管理系统,用于建立、使用和维护数据库。SQL Server一开始并不是微软自己研发的产品,而是当时为了要和IBM竞争时,与Sybase合作所产生的,其最早的发展者是Sybase,同时微软也和Sybase合作过 SQL Server 4.2版本的研发,微软亦将SQL Server 4.2移植到Windows NT(当时为3.1版),在与Sybase终止合作关系后,自力开发出SQL Server 6.0版,往后的SQL Server即均由微软自行研发。MySQL 是一个关系型数据库,由瑞典 MySQL AB 公司开发,目前属于 Oracle 旗下公司。MySQL 最流行的关系型数据库管理系统,在 WEB 应用方面 MySQL 是最好的 RDBMS (Relational Database Management System,关系数据库管理系统) 应用软件之一。MySQL 是一种关联数据库管理系统,关联数据库将数据保存在不同的表中,而不是将所有数据放在一个大仓库内,这样就增加了速度并提高了灵活性。MySQL 所使用的 SQL 语言是用于访问数据库的最常用标准化语言。MySQL 软件采用了双授权政策(本词条"授权政策"),它分为社区版和商业版,由于其体积小、速度快、总体拥有成本低,尤其是开放源码这一特点,一般中小型网站的开发都选择 MySQL 作为网站数据库。由于其社区版的性能卓越,搭配 PHP ,Linux和 Apache 可组成良好的开发环境,经过多年的web技术发展,在业内被广泛使用的一种web服务器解决方案之一,称之为LAMP。sql server 2005 是 mssql,ms的意思是microsoft,也就是微软,sql server是微软开发的 mysql是另外一款关系型数据库软件。
5,nosql数据库是什么 具有代表性以keyvalue的形式存储的
NoSQL,泛指非关系型的数据库。随着互联网web2.0网站的兴起,传统的关系数据库在应付web2.0网站,特别是超大规模和高并发的SNS类型的web2.0纯动态网站已经显得力不从心,暴露了很多难以克服的问题,而非关系型的数据库则由于其本身的特点得到了非常迅速的发展。NoSQL数据库的产生就是为了解决大规模数据集合多重数据种类带来的挑战,尤其是大数据应用难题。键值(Key-Value)存储数据库这一类数据库主要会使用到一个哈希表,这个表中有一个特定的键和一个指针指向特定的数据。Key/value模型对于IT系统来说的优势在于简单、易部署。但是如果DBA只对部分值进行查询或更新的时候,Key/value就显得效率低下了。[3] 举例如:Tokyo Cabinet/Tyrant, Redis, Voldemort, Oracle BDB.列存储数据库。这部分数据库通常是用来应对分布式存储的海量数据。键仍然存在,但是它们的特点是指向了多个列。这些列是由列家族来安排的。如:Cassandra, HBase, Riak.文档型数据库文档型数据库的灵感是来自于Lotus Notes办公软件的,而且它同第一种键值存储相类似。该类型的数据模型是版本化的文档,半结构化的文档以特定的格式存储,比如JSON。文档型数据库可 以看作是键值数据库的升级版,允许之间嵌套键值。而且文档型数据库比键值数据库的查询效率更高。如:CouchDB, MongoDb. 国内也有文档型数据库SequoiaDB,已经开源。图形(Graph)数据库图形结构的数据库同其他行列以及刚性结构的SQL数据库不同,它是使用灵活的图形模型,并且能够扩展到多个服务器上。NoSQL数据库没有标准的查询语言(SQL),因此进行数据库查询需要制定数据模型。许多NoSQL数据库都有REST式的数据接口或者查询API。[2] 如:Neo4J, InfoGrid, Infinite Graph.因此,我们总结NoSQL数据库在以下的这几种情况下比较适用:1、数据模型比较简单;2、需要灵活性更强的IT系统;3、对数据库性能要求较高;4、不需要高度的数据一致性;5、对于给定key,比较容易映射复杂值的环境。大家有没有听说过“NoSQL”呢?近年,这个词极受关注。看到“NoSQL”这个词,大家可能会误以为是“No!SQL”的缩写,并深感愤怒:“SQL怎么会没有必要了呢?”但实际上,它是“Not Only SQL”的缩写。它的意义是:适用关系型数据库的时候就使用关系型数据库,不适用的时候也没有必要非使用关系型数据库不可,可以考虑使用更加合适的数据存储。 为弥补关系型数据库的不足,各种各样的NoSQL数据库应运而生。 为了更好地了解本书所介绍的NoSQL数据库,对关系型数据库的理解是必不可少的。
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