老鼠的基因数据库是哪个,最近像查询爬行动物的线粒体全基因组可是NCBI上基本上只能查到
来源:整理 编辑:黑码技术 2023-10-27 00:26:16
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1,最近像查询爬行动物的线粒体全基因组可是NCBI上基本上只能查到
ncbi中歌呢数据库只能查找基因序列~你需要知道线粒体都有哪些基因再进行查找~
2,MGD什么意思
MGD : Millions of Gallons per Day 几百万加仑MGD : Mouse Genome Database 老鼠基因组数据库MGD : Military Geographic Documentation 军事地理文档MGD : Magdalena, Bolivia 玻利维亚MGD : mixed gonadal dysgenesis 混合型性腺发育不良MGD : Meguma Gold Deposits 金矿床
3,小鼠染色体的特点
没办法,只能出杀手锏了:你到小鼠基因组信息学(mouse genome informatics)看吧!小鼠基因组数据库(MGD)整合了小鼠的遗传的和基因组的数据,为了促进小鼠作为模式系统来理解人类生物学和疾病过程的使用。MGD努力的一个核心部件是有关小鼠基因和基因产物的基因组的,遗传的,功能的和表型的信息的获得与整合。小鼠基因组数据库(MGD)整合了小鼠的遗 传的和基因组的数据,为了促进小鼠作为 模式系统来理解人类生物学和疾病过程的 使用。MGD努力的一个核心部件是有关小 鼠基因和基因产物的基因组的,遗传的, 功能的和表型的信息的获得与整合。中间的着丝粒被牵引所致。 ---< >---- 这个样子,因此就呈v形了能清楚的看到染色体的时候一般是细胞分裂中后期,此时附着在染色体着丝粒上的纺锤丝将姐妹染色体单体拉离并向两极移动,所以就呈现着丝粒在前,两臂随后的形状了。
4,怎么找小鼠某些代谢通路基因的全序列
代谢通路:目前在通路数据库(PATHWAY database) 中代谢通路是建立得最好的,有大约90个参考代谢途径的图形。每个参考代谢途径是一个由酶或EC号组成的网络。利用如下方法可通过计算机构建出生物体特有 的代谢通路:先根据基因的序列相似性和位置相关性确定基因组中酶的基因。然后合理地安排EC号。最后将基因组中的基因和参照通路中用EC号编号的基因产物 结合起来。转基因小鼠就是基因组中含有外源基因的小鼠。它是按照预先的设计,通过细胞融合、细胞重组、遗传物质转移、染色体工程和基因工程技术将外源基因导入精子、卵细胞或受精卵,再以生殖工程技术而发育。用以改变普通小鼠的性状.基因敲除是基因打靶技术的一种,类似于基因的同源重组。指外源dna与受体细胞基因组中序列相同或相近的基因发生同源重组,从而代替受体细胞基因组中的相同/相似的基因序列,整合入受体细胞的基因组中。此法可产生精确的基因突变,也可正确纠正机体的基因突变。基因嵌入又称基因置换,它是利用内源基因序列两侧或外面的断裂点,用同源序列的目的基因整个置换内源基因。用以研究某一基因的作用.
5,小鼠circrna数据库齐全吗
1、starBase 一个高通量实验数据CLIP-Seq(或称为HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP)和mRNA降解组测序数据支持的microRNA靶标数据库,包含了miRNA-mRNA,miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA,miRNA-ceRNA 和RNA-protein等的调控关系。整合和构建多个流行的靶标。随着对circrna研究的越来越多,已知的circrna数据信息在快速增长,在这里我们肽度时界(timedoo)整理了当前circrna相关的数据库列表,希望能帮到您:1.circbase[1],是一个通过收集和整合已经发布的circrna数据构建的数据库。目前该数据库收集包括以下6个物种的circrna信息:人 (hg19)、小鼠(mm9) 、秀丽线虫(ce6)、黑腹果蝇 (dm3)、矛尾鱼 (latcha1)、腔棘鱼 (latcha1)。该数据库最新版本发布时间为2014年1月。网址:http://www.circbase.org/。通过在搜索界面中的list search提交circbase支持的circrna id号或基因组区域位置信息,可以快速查询相关circrna信息;研究者也可以通过tablebrowser进行条件设置,筛选自己所需要的circrna数据。2.circrnabase[2] , 该数据库通过整合已发表的circrna数据,构建mirna与circrna以及circrna与rna结合蛋白(rbp)的互作网络。最新版本发布时间:2013年12月 。网址:http://starbase.sysu.edu.cn/mircircrna.php3.circ2traits[3] ,是一个收集与人类疾病或性状潜在关联的circrna数据库。该数据库通过预测mirnas和人类的蛋白质编码基因、长链非编码基因及环状rna间的相互作用关系,构建了相互作用网络, 并对mirnas-circrna相互作用组中的蛋白编码基因进行了go富集分析;此外,将与疾病相关的snps位点定位到circrna基因座上,并鉴定了环状rnas上的ago相互作用位点。最新版本发布时间:2013年12月 。网址:http://gyanxet-beta.com/circdb/4.circnet[4],利用464个rna-seq测序数据,进行新circrna预测及基因组注释,并计算已知的及新预测的circrna表达情况,构建circrna-mirna-genet调控网络,以上信息均可从该数据库获得。版本发布时间:2015年12月 。网址:http://circnet.mbc.nctu.edu.tw/5.deepbase v2.0[5]平台, 该数据平台收集了大约15万多的circrna基因(人、鼠、果蝇、线虫等),并构建了最全面的circrna的表达图谱。最新版本发布时间:2015年10月 网址:http://deepbase.sysu.edu.cn/6.circinteractome[6]该数据库预测了已知的109个rna结合蛋白数据集与circbase中的circrna的结合位点,并利用targetscan软件预测了mirnas与circrna的潜在结合位点。最新版本发布时间:2015年12月网址:http://circinteractome.nia.nih.gov/你也可以上肽度时界(timedoo)查看circrna(环状rna)学术解读资料。
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