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1,关于TCGA数据库的问题新手求助

这种东西是看不出来是否判断与肿瘤有关的,肿瘤本身具有远端转移特性,从各个组织中都有可能存在。所以如果想要看pathway是否与肿瘤相关,就需要点进去查看相关文献,把各种蛋白摸透,才能够搞定,如果仅仅凭借go数据库的pathway来的就能判断了

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2,如何利用数据库查询细胞某基因表达情况

uniprot数据库里找到这个基因 页面里有表达相关的数据库链接 。
一个良好的开端就是分析感兴趣基因的突变和其它异常,icgc数据门户提供了几条研究路线。输入一个基因名称,ncbi登录号,或者ensembl基因id,点击基因报告(gene report),就能在突变摘要(mutation summary)中找到已发现的突变和拷贝数变化,以及迄今为止,这些突变在肿瘤中出现的频率。cosmicsection就在体细胞突变列表下方,包括了点突变,少量缺失,以及插入突变等方面的数据。

如何利用数据库查询细胞某基因表达情况

3,如何利用数据库查询细胞某基因表达情况

一个良好的开端就是分析感兴趣基因的突变和其它异常,ICGC数据门户提供了几条研究路线。输入一个基因名称,NCBI登录号,或者Ensembl基因ID,点击基因报告(Gene Report),就能在突变摘要(Mutation Summary)中找到已发现的突变和拷贝数变化,以及迄今为止,这些突变在肿瘤中出现的频率。COSMICsection就在体细胞突变列表下方,包括了点突变,少量缺失,以及插入突变等方面的数据。
uniprot数据库里找到这个基因 页面里有表达相关的数据库链接 。

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